Katrin Eggenberger a entamé sa carrière professionnelle en 2002, encore durant sa scolarité, par un stage d’un an auprès de la LGT Bank au Liechtenstein. Elle a ensuite travaillé dans la banque privée et la gestion de portefeuille à la VP Bank (2004-2008), puis en tant que responsable de la gestion d’actifs fondée sur des fonds à la Notenstein Private Bank (2008-2014), où elle a également siégé au conseil d’administration. De 2016 à 2019, elle a occupé des fonctions de direction au Forum économique mondial (WEF), notamment comme cheffe de cabinet et responsable d’UpLink, la plateforme d’innovation. Elle a obtenu en 2019 un doctorat en sciences politiques à l’Université de Saint-Gall (HSG), avec une thèse sur les impôts, les sanctions et l’extraterritorialité, sous la direction du prix Nobel Joseph E. Stiglitz. De 2019 à 2021, elle a été ministre des Affaires étrangères, de la Justice et de la Culture de la Principauté du Liechtenstein. De 2022 à 2023, elle a été conseillère principale en transport et infrastructures à la Banque interaméricaine de développement (BID) à Washington, D.C.

Depuis 2021, elle est conseillère principale chez Agora Strategy Group (Allemagne), stratège en chef et administratrice chez AISquare Inc. (États-Unis), présidente du conseil d’administration de CIOS (Suisse), membre des conseils d’administration de Deon Digital AG (Suisse/Danemark) et de la Fondation Pro Futura, ainsi que présidente de l’AdBoard Ost chez Implenia (Suisse).Elle est également membre du conseil d’administration de la Fondation Pro Futura pour la jeunesse et du Centre de culture et de congrès Verrucano en Suisse.